MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR02

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006970	TTCC	2	8	54	61	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_006970	GCA	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006970	GCC	2	6	131	136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006970	CGG	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006970	GCCG	2	8	229	236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_006970	CGG	2	6	299	304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006970	GTA	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006970	ACCGC	2	10	365	374	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_006970	CTTGC	2	10	429	438	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_006970	GGTCCA	2	12	442	453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006970	GCA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006970	AC	3	6	475	480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006970	AAG	2	6	533	538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006970	TC	3	6	592	597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006970	GGGA	2	8	634	641	25 %	0 %	75 %	0 %	62718929
16	NC_006970	GC	3	6	655	660	0 %	0 %	50 %	50 %	62718929
17	NC_006970	C	6	6	660	665	0 %	0 %	0 %	100 %	62718929
18	NC_006970	GTG	2	6	702	707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	62718929
19	NC_006970	G	6	6	718	723	0 %	0 %	100 %	0 %	62718929
20	NC_006970	GT	3	6	731	736	0 %	50 %	50 %	0 %	62718929
21	NC_006970	CGGT	4	16	743	758	0 %	25 %	50 %	25 %	62718929
22	NC_006970	CGC	2	6	769	774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718929
23	NC_006970	GCCT	2	8	877	884	0 %	25 %	25 %	50 %	62718929
24	NC_006970	CAC	2	6	886	891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62718929
25	NC_006970	CGC	2	6	892	897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718929
26	NC_006970	AC	3	6	989	994	50 %	0 %	0 %	50 %	62718929
27	NC_006970	CCAAT	2	10	1075	1084	40 %	20 %	0 %	40 %	62718929
28	NC_006970	ACC	2	6	1107	1112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62718929
29	NC_006970	TGC	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006970	CCT	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62718930
31	NC_006970	AAC	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62718930
32	NC_006970	GGC	2	6	1432	1437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62718930
33	NC_006970	CGC	2	6	1464	1469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718930
34	NC_006970	TCC	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	62718930
35	NC_006970	CCG	2	6	1629	1634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718930
36	NC_006970	ACAA	2	8	1665	1672	75 %	0 %	0 %	25 %	62718930
37	NC_006970	CCG	2	6	1688	1693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	62718930
38	NC_006970	GAGCTG	2	12	1701	1712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	62718930
39	NC_006970	CGAGC	2	10	1734	1743	20 %	0 %	40 %	40 %	62718930
40	NC_006970	CGG	2	6	1765	1770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	62718930
41	NC_006970	AAC	2	6	1771	1776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62718930
42	NC_006970	AC	4	8	1814	1821	50 %	0 %	0 %	50 %	62718930
43	NC_006970	AAC	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62718930
44	NC_006970	GGA	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	62718930
45	NC_006970	CCA	2	6	1887	1892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62718930
46	NC_006970	AGCA	2	8	1915	1922	50 %	0 %	25 %	25 %	62718930
47	NC_006970	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	62718930
48	NC_006970	GCG	2	6	2089	2094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006970	AGC	2	6	2234	2239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006970	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006970	GC	3	6	2286	2291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006970	ATC	2	6	2326	2331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006970	CAGCG	2	10	2370	2379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_006970	CCG	2	6	2442	2447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_006970	CCT	2	6	2456	2461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_006970	CTC	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006970	AGC	2	6	2532	2537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006970	GCC	2	6	2574	2579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_006970	GCT	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006970	CGG	2	6	2598	2603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006970	GT	3	6	2634	2639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006970	ATC	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006970	TCG	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.